《长江保护法》立足国情，超越既有立法中的“部门”与“地方”结构，在保留既有管理体制的基础上，创造性地提出多重流域统筹协调，推动了我国流域管理体制从“条块分割”到“统筹协调”的重大变革。《环境保护》杂志2021年第3-4期刊登的《多重流域统筹协调：〈长江保护法〉的流域管理体制创新》一文指出，《长江保护法》以国家和地方流域协调机制“统筹协调”长江流域横向管理关系，以综合管理“统筹协调”长江流域自然地理空间和法律管理空间，以规范政府职能“统筹协调”长江流域权力配置之重叠、冲突和空白。在中央层面，国家长江流域协调机制“统筹协调”流域性重大事项；在地方层面，长江流域地方协调机制“统筹协调”地方协同合作；对当前长江流域亟须“统筹协调”的关键事项，采用直接列举的方法，按照面向长江的流域性问题——长江流域的特殊性问题的逻辑结构，设计了具体的机制和制度。作者指出，《长江保护法》即将生效，应尽快制定配套立法，助力长江流域“统筹协调”落地实施。